Infrastruktur och resurser
Listan nedan kommer successivt att fyllas på. Hör av dig om du vill komplettera informationen!
BioVis
BioVis-plattformen vid Uppsala universitet ger dig en unik kombination av teknik och kunskap för visualisering av biologiska prover på vävnads-, cell- och subcellulär nivå. Vi är specialiserade på mikroskopi, elektronmikroskopi, flödescytometri och bildanalys. Vi kan erbjuda avancerad elektron, konfokal- och 2Photon-mikroskopi, samt analytisk flödescytometri och cellsortering. Medicinska och farmaceutiska fakulteten vid Uppsala universitet stöder BioVis ekonomiskt, så användaravgifterna kan hållas låga.
Kontakt: Dirk Pacholsky
Centrum för digital humaniora vid Uppsala universitet (CDHU)
CDHU koordinerar den digitala omvandlingen av humaniora och samhällsvetenskap. Det övergripande och infrastrukturellt orienterade uppdraget och slutmålet för CDHU finansieras av rektor i syfte att utveckla digitala resurser och arbetsflöden för humaniora och samhällsvetenskap. CDHU verkar i samarbete med andra enheter vid Uppsala universitet och på en inter/nationell nivå. Infrastrukturen omfattar både teknisk personal och en molnbaserad lösning, som stöder:
- lagrings- och beräkningsutrymme för forskningsimplementering;
- tillgång till verktyg och metoder för analys av olika slags data (text, bild, ljud, etc.); samt
- forskningsprojekt inom humaniora och samhällsvetenskap.
Kontakt: Karl Berglund
iLab
Universitetets administrativa system för forskningsinfrastruktur (iLab) underlättar det administrativa arbetet med projekthantering/bokningar/beställningar av service och resurser.
Plattformen för preklinisk PET-MRI
Positronemissionstomografi (PET) och Single Photon Emission Tomography (SPECT) är metoder för molekylär avbildning som används allt mer inom biomedicinsk forskning. Vid plattformen överbryggar vi spannet mellan grundforskning i läkemedelskemi och kliniska applikationer av molekylär avbildning med PET och SPECT.
Kontakt: Sergio Estrada
SciLifeLab Ancient DNA
SciLifeLab Ancient DNA utför analys av forntida dna som en tjänst för arkeologer, biologer, museipersonal och andra. Vi tillhandahåller arbete med prover och dna i renrumslaboratorium, och specialiserad analys av dna-data.
Kontakt: Magnus Lundgren
SciLifeLab Uppsala Genome Center
SciLifeLab Uppsala Genome Center utför DNA-extraktioner från en mängd olika källor, sekvensering med sk. long-read teknologier som PacBio, Oxford Nanopore och IonTorrent samt assemblies av sekvensdata.
Kontakt: Susanne Hellstedt Kerje
Simpler
SIMPLER, Swedish Infrastructure for Medical Population-based Life-course and Environmental Research, är en nationell forskningsinfrastruktur för hypotesdriven och datadriven epidemiologisk forskning. 110,000 kvinnor och män, Svenska Mammografikohorten och Kohorten av Svenska Män, har regelbundet svarat på enkäter med frågor om hälsa, kost och livsstil, och de kliniska subkohorterna som inkluderar 13,500 kvinnor och män bidrar med en stor bredd av omicsdata och biologiska prover. Uppsala universitet är värdorganisation för SIMPLER, som förvaltas av ett konsortium bestående av Uppsala universitet, Karolinska Institutet, Chalmers tekniska högskola och Örebro universitet med stöd från regionerna i Uppsala, Västmanland och Örebro. Kontakt: Anna-Karin Kolseth
Uppsala Biobank och Uppsala BioLab
Uppsala Biobank och Uppsala BioLab är en forskningsinfrastruktur och ett kompetenscenter för biobanksrelaterade frågor genom ett samarbete mellan Uppsala Universitet och Region Uppsala. Uppsala Biobank erbjuder service för insamling, förvaring och utplock med spårbarhet av prov och provinformation. Uppsala BioLab erbjuder service for DNA extraktion, cellpreparation från blod och benmärg, analys av biomarkörer och utveckling av metoder och instrument i samarbete med forskare och företag.
Kontakter: Mikaela Magnusson, Susanne Aldén